Tổng giám mục Giuse Ngô Quang Kiệt được tấn phong giám mục năm 1999, dưới thời Giáo hoàng Gioan Phaolô II, bởi:[388]

• Giám mục Chủ phong: Giám mục chính tòa Giáo phận Long Xuyên Gioan Baotixita Bùi Tuần
• Hai giám mục Phụ phong: Giám mục Emmanuel Lê Phong Thuận, giám mục chính tòa Giáo phận Cần Thơ và giám mục Phanxicô Xaviê Nguyễn Văn Sang, giám mục chính tòa Giáo phận Thái Bình.

Tổng giám mục Giuse Ngô Quang Kiệt là giám mục Chủ phong cho các giám mục:[388]

• Năm 2007, giám mục Giuse Đặng Đức Ngân, hiện đang là Giám mục chính tòa Giáo phận Đà Nẵng.
• Năm 2008, giám mục Lôrensô Chu Văn Minh, hiện là Nguyên Giám mục Phụ tá Tổng giáo phận Hà Nội.

Tổng giám mục Giuse Ngô Quang Kiệt là giám mục Phụ phong cho các giám mục:[388]

• Năm 2001, giám mục Giuse Vũ Duy Thống, cố giám mục chính tòa Giáo phận Phan Thiết.
• Năm 2003, giám mục Stêphanô Tri Bửu Thiên, hiện đang là Giám mục chính tòa Giáo phận Cần Thơ.
• Năm 2003, giám mục Antôn Vũ Huy Chương, hiện là nguyên giám mục chính tòa Giáo phận Đà Lạt.
• Năm 2004, giám mục Giuse Nguyễn Chí Linh, hiện đang là Tổng giám mục Tổng giáo phận Huế.
• Năm 2006, giám mục Phêrô Nguyễn Văn Đệ, hiện đang là Giám mục chính tòa Giáo phận Thái Bình.